Alors que Deku, Katsuki et Shoto suivent Endeavor pour endiguer la menace, Deku se retrouve accidentellement impliqué dans un incident et activement recherché par les autorités. Mais l’horloge tourne et…

L’histoire du nouveau film se déroule dans la forêt d’Okoya, un paradis Pokémon protégé par des règles strictes qui interdisent aux étrangers de mettre le pied à l’intérieur……

Misato et son groupe anti-NERV, Wille, arrivent à Paris rougie par la core-ization…….

Ainsi, tout le monde se retrouve embarqué dans l’affaire relative au décès de la reine et du prince de Vespania.

Sacha, Ondine et Pierre font la connaissance de Mewtwo, un Pokémon créé de toutes pièces et prêt à en découdre.

14 ans se sont écoulés depuis la fin du second film, Asuka est chargée, en compagnie de Mari, de récupérer le Tesseract dans lequel est scellé l’EVA-01, lorsqu’elle est intercepté…